Entre los principales desafíos que enfrenta la UGIP se encuentra el acompañar fortalecimiento de la calidad de la Formación Inicial Docente, asegurando que los planes de estudio estén alineados con los estándares nacionales e internacionales y con las demandas del sistema educativo actual. Esto implica actualizar constantemente los enfoques pedagógicos, fomentar la innovación didáctica y mejorar los procesos de evaluación, especialmente en un contexto de transformaciones sociales, culturales y tecnológicas que impactan directamente en la enseñanza.

Otro desafío clave es consolidar una cultura de colaboración entre las distintas unidades académicas que imparten carreras de Pedagogía, promoviendo el trabajo interdisciplinario y la integración de saberes. A su vez, la UGIP debe seguir impulsando la articulación entre la formación teórica y las prácticas en terreno, fortaleciendo los vínculos con las escuelas del sistema escolar regional y generando espacios para la retroalimentación continua, con el fin de formar docentes comprometidos, reflexivos y preparados para contribuir activamente a la mejora de la educación en la Región de Coquimbo y el país.